Skip to content

Request from @aurelbzh #69

@dridk

Description

@dridk
  • Visualiser des vcfs et des vcfs annotés : les vcfs et ou les vcfs annotés peuvent être chargés dans le logiciel et visualisé grâce à la GUI.
  • Annoter des variants par l’intermédiaire d’une interface graphique facile d’utilisation.
  • Traiter des fichiers bam pour la couverture : l’utilisateur doit avoir des informations sur la couverture et la profondeur de séquençage.
  • l’interface doit pouvoir permettre d’explorer les données du ou des projet(s) de l’utilisateur.
  • l’interface graphique doit donner accès à des bases de données publiques et ou privés d’annotation :
    [mettre ici les base de données obligatoires et ou souhaitées]
  • Accès aux informations sur les gènes liés aux variants : l’interface graphique doit donner l’information sur les gènes, trouvable dans les bases de données.
  • Réaliser des filtres sur les données : l’utilisateur doit pouvoir faire des filtres et ou utilisé des filtre existants pour rechercher ou sélectionner les variants qui l’intéresse.
  • Système d’authentification : le logiciel doit disposer d’un système d’authentification qui doit pouvoir être gérer par l’administrateur.
  • Séparés les données par projet : les données doivent pouvoir être séparée par projet et l’accès au(x) projet(s) doit pouvoir être régulé par les administrateurs.
  • Système administrateur pour ajouter des données : l’administrateur doit pouvoir ajouter des données de façon aisées.
  • Annoter des variants non codants.
  • existence d’une base de données locale de variants.

Metadata

Metadata

Assignees

No one assigned

    Labels

    No labels
    No labels

    Type

    No type

    Projects

    No projects

    Milestone

    No milestone

    Relationships

    None yet

    Development

    No branches or pull requests

    Issue actions